Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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