Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms