Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cldn9Q9Z0S7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn9Q9Z0S7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn9Q9Z0S7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn9Q9Z0S7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn9Q9Z0S7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn9Q9Z0S7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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