Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4s1Q9WVL1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms