Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scnn1gQ9WU39 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Scnn1gQ9WU39 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms