Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrf1Q9WU00 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms