Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms