Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rfwd2Q9R1A8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms