Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Wdr54Q9R0D8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms