Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a4Q9QZR9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms