Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapbQ9QY76 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapbQ9QY76 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms