Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd4Q9QY39 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd4Q9QY39 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms