Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolkQ9QUG2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolkQ9QUG2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms