Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Col5a3Q9JLI2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Col5a3Q9JLI2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms