Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkd2l2Q9JLG4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms