Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx6Q9JKK1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms