Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a4Q9JIS8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms