Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1fQ9JIS7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms