Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc6l2Q9JIM3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms