Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pus3Q9JI38 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms