Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htr3bQ9JHJ5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms