Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn12Q9ET43 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn12Q9ET43 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms