Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms