Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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