Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aff4Q9ESC8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms