Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb3Q9ERD7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb3Q9ERD7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms