Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpsf1Q9EPU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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