Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn1Q9EPL2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms