Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trmt112Q9DCG9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms