Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcg8Q9DBM0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcg8Q9DBM0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms