Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med27Q9DB40 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms