Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc103Q9D9P2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms