Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc70Q9D9B0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc70Q9D9B0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc70Q9D9B0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc70Q9D9B0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc70Q9D9B0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc70Q9D9B0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms