Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx5Q9D8U8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx5Q9D8U8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx5Q9D8U8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx5Q9D8U8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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