Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms