Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa5Q9D7I0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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