Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms