Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms