Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933421I07RikQ9D420 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933421I07RikQ9D420 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933421I07RikQ9D420 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms