Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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