Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms