Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms