Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms