Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Elp3Q9CZX0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms