Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms