Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ssu72Q9CY97 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ssu72Q9CY97 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms