Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fcf1Q9CTH6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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