Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smim8Q9CQQ0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms