Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9CQM1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms