Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ndufb9Q9CQJ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms